【摘 要】
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利用分子动力学模拟方法,研究了原核生物核糖体小亚基中的16SrRNA片段与氨基糖苷类抗生素巴龙霉素复合物结构的柔性.结果表明,16SrRNA片段中的1408位点的腺嘌呤（A）突变为鸟嘌呤
【基金项目】
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国家自然科学基金（批准号：60971089）资助
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利用分子动力学模拟方法,研究了原核生物核糖体小亚基中的16SrRNA片段与氨基糖苷类抗生素巴龙霉素复合物结构的柔性.结果表明,16SrRNA片段中的1408位点的腺嘌呤（A）突变为鸟嘌呤（G）,改变了与tRNA中反密码子环识别相关的2个腺嘌呤A1492和A1493的空间构象,阻碍了氨基糖苷类抗生素与核糖体的结合,从而影响原核生物蛋白转录过程.模拟结果与实验测定的晶体结构相吻合,可为基于核糖体16SrRNA的药物分子设计提供较可靠的结构信息.
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