【摘 要】
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研究病毒内源性非编码小RNA(VmiRNA)的靶标基因,有助于阐释病毒和宿主的互作关系及制定对病毒的防控策略.利用Solexa高通量测序技术及生物信息学方法,从柞蚕核型多角体病毒(A
【机 构】
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大连理工大学生命科学与技术学院,辽宁大连116024;辽东学院农学院,辽宁丹东118001;大连理工大学生命与医药学院,辽宁盘锦124221
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研究病毒内源性非编码小RNA(VmiRNA)的靶标基因,有助于阐释病毒和宿主的互作关系及制定对病毒的防控策略.利用Solexa高通量测序技术及生物信息学方法,从柞蚕核型多角体病毒(ApNPV)基因组中筛选出VmiRNA成熟体MD5,在预测其作用的宿主靶基因基础上,通过GO数据库分析靶基因的功能.结果显示由ApNPV的VmiRNA MD5调控的宿主靶基因涉及细胞组成、分子功能、生物学过程等生物学途径,主要参与细胞内的分子结合、酶催化和免疫反应,其中与柞蚕免疫相关的靶基因共有4个.实时荧光定量PCR检测柞蚕蛹经ApNPV诱导处理后VmiRNA MD5在脂肪体内明显上调表达(与对照相比提高了8倍),而与宿主免疫相关的3个靶基因的表达水平明显下调.对VmiRNA MD5 5'端上游启动子序列结构的分析显示,其含有免疫相关转录因子GMCSF、p53等的结合位点.推测VmiRNA MD5可能参与调控宿主柞蚕免疫相关基因的表达.
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