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Arcobacter butzleri脂蛋白的in silico方法鉴定与功能分析

来源 :中国人兽共患病学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：WSZYC

【摘 要】

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目的鉴别已公布基因组序列的Arcobacter butzleri RM4018株的脂蛋白（Lpp）。方法首先从GenBank获取由A.butzleriRM4018基因组推测的蛋白质氨基酸序列,然后利用Lpp预测软件Prosit

【作 者】

：

孙理云 

【机 构】

：

河南科技大学动物科技学院

【出 处】

：

中国人兽共患病学报

【发表日期】

：

2010年10期

【关键词】

：

Arcobacter butzleri 脂蛋白 生物信息学分析 功能预测 Arcobacter butzleri  lipoprotein  bioinform 

【基金项目】

：

河南科技大学人才科研基金（05-10）资助

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目的鉴别已公布基因组序列的Arcobacter butzleri RM4018株的脂蛋白（Lpp）。方法首先从GenBank获取由A.butzleriRM4018基因组推测的蛋白质氨基酸序列,然后利用Lpp预测软件PrositeScan和DOLOP预测05ZYH33株的Lpp,采用SignalP 3.0 HMM、PrediSi、Phobius、LipoP-HMM和TMHMM version 2.0分析预测的Lpp的信号肽,然后经＂多数票决法＂确定Lpp;最后利用InterProScan和BlastP服务器

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