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准确把握研究所的发展现状和学科创新能力，合理配置资源，优化机构设置，建立新型农业科技创新体系，需要对研究所进行评估。通过评估摸清研究所的科研实力，为各级主管部门择优支持、改进科研管理工作提供依据。文章以有关科研管理机构的评估指标体系为基础，参考福建省农业科学院评估体系，建立了省级农业科研单位和重点学科评估指标体系，对省级农业科研单位综合能力评估方法进行了初步探讨，供科研管理部门参考。