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颗粒图像分析中聚堆目标的分离对目标的计数及特征的提取非常重要.现有分离算法都要求聚堆目标粘连处凹陷比较明显,并且/或者存在灰度局部最小边缘.菌群聚堆细胞大小不一、聚堆形态各异,多数聚堆细胞并不具备上述条件.文中提出了一种基于聚堆区域轮廓跟踪、删除的分离算法,依据跟踪“虫”在跟踪过程中遇到已跟踪过轮廓点的情况判断分离的进行.实验结果表明算法对菌群聚堆细胞分离的成功率要高于现有算法10%以上.