为探讨低氧诱导因子1α(hypoxia inducible factor1alpha,HIF-1α)在藏羚羊(Pantholops hodgsonii)高原低氧适应机制中的作用,采用RT-PCR和RACE技术克隆藏羚羊HIF-1α基因的cDNA序列,同时采用real-time PCR和Western blot方法检测藏羚羊、藏系绵羊、平原绵羊HIF-1α的组织特异性表达,并进行比较分析。序列分析结果表明,克隆所得的cDNA序列为3664bp,包含2471bp的开放阅读框和1191bp的3’UTR区。它的编码区序列和预测的氨基酸序列与其它哺乳动物HIF-1α的相似性超过87%,其中与牛相似性最高,达到98%以上,表明该序列为藏羚羊HIF-1α基因的cDNA序列。基因表达检测结果显示,HIF-1α在藏羚羊的肺、心肌、骨骼肌中均有表达,其中肺的表达量最高,表现出明显的组织差异性。进一步研究表明,藏羚羊和藏系绵羊的HIF-1α蛋白在上述三种组织中的表达量均高于平原绵羊,并且HIF-1αmRNA和蛋白在藏羚羊心、肺和骨骼肌中的表达量高于藏系绵羊。提示HIF-1α的低氧特异表达是藏羚羊高原低氧适应的分子基础。