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人类进行马的育种工作已经持续很多世纪，并育成了阿拉伯马(Arab)、纯血马(Thoroughbred)等著名品种。这些马种育成的成功经验之一就是进行严格的品种登记制度。最初品种登记是依靠马匹外貌特征，后来发展到借助血型、蛋白质和酶多态型来进行。近年来随着生物技术的发展，可以直接对编码蛋白质或酶的基因进行分析，因而基于DNA水平的个体识别和亲仔鉴定的检测方法不断出现。其中最有效的方法之一就是以PCR为基础的微卫星DNA多态性检测技术。 微卫星DNA是一类以2～6bp的短核苷酸序列为基本单位串联重复状散在分