绵羊GnRHR基因生物信息学分析

来源 :基因组学与应用生物学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:gongzi2009
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促性腺激素释放激素受体(gonadotropin releasing hormone receptor,GnRHR)是绵羊(Ovis aries)繁殖性状相关的主效基因,基因结构复杂.本研究以GnRHR基因序列及编码蛋白序列为材料,通过生物信息学方法分析了GnRHR基因的DNA序列、启动子及CpG岛、RNA结构及该蛋白的理化性质、亚细胞定位、跨膜区域、互作蛋白、系统发育等.结果 表明,绵羊GnRHR位于6号染色体,潜在核心启动子在1 124~1 174 bp,没有CpG岛.GnRHR基因编码328个氨基酸残基,其分子量为34 252.82 Da,Leu(亮氨酸)所占比例最高,为14.94%;该蛋白定位于内质网,有7个跨膜结构区域;主要的二级结构元件是α-螺旋结构和无规卷曲,包含一个SAM-dependent MTase功能结构域,同时有10个可能的互作蛋白;进化分析表明牛与绵羊GnRHR蛋白亲缘关系最近.本研究结果为进一步深入研究GnRHR的具体基因功能和对绵羊繁殖性能的研究提供帮助.
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