香猪3种组织环状RNA的表达及其功能分析

来源 :中国畜牧兽医 | 被引量 : 0次 | 上传用户：luckycpw

【摘要】

：

本研究旨在探索环状RNA(circular RNA,circRNA)在香猪皮肤、皮下脂肪及背最长肌的表达及其潜在功能。本研究采用RNA-Seq技术和生物信息学方法,分析香猪皮肤、皮下脂肪及背最

【作者】

：

张晓冉雪琴牛熙黄世会王嘉福

【机构】

：

贵州大学生命科学学院,贵州大学动物科学学院,毕节医学高等专科学校

【出处】

：

中国畜牧兽医

【发表日期】

：

2020年12期

【关键词】

：

香猪环状RNA(circRNA) 皮肤皮下脂肪背最长肌 Xiang pig circular RNA(circRNA) skin subcutaneous

【基金项目】

：

国家自然科学基金(31672390、31960641),国家高技术研究发展计划(863计划)课题(2013AA102503),贵州省科技创新人才团队项目(黔科合平台人才[2019]5615号),贵州省“百”层次创新型人才培养项目(黔科合人才[2016]4012号),贵州省农业攻关项目(黔科合支撑[2017]2585、[2017]2587号),贵州大学培育项目(黔科合平台人才[2018]5781-4

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本研究旨在探索环状RNA(circular RNA,circRNA)在香猪皮肤、皮下脂肪及背最长肌的表达及其潜在功能。本研究采用RNA-Seq技术和生物信息学方法,分析香猪皮肤、皮下脂肪及背最长肌circRNA的表达,对3种组织特有circRNA亲本基因进行GO和KEGG富集分析,对样品组织结构功能相关亲本基因中circRNA结合的靶miRNA进行预测。从香猪3种组织表达谱中共鉴定出6483个circRNAs,皮肤、皮下脂肪及背最长肌分别鉴定出4575、5180、5219个circRNAs,其中特异性表达

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