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分别研究了徐闻3种滨珊瑚的ITS1和ITS2基因的碱基组成和G+C含量,并和己上传至Genbank上的其他9种滨珊瑚的ITS序列进行比较研究了徐闻三种滨珊瑚的系统发生关系.序列分析结果显示,3种滨珊瑚的ITS1的长度范围是205bp～209bp,G+C含量为37.6％～45.5％,ITS2的长度范围192bp～226bp,G+C含量为45.1％～50.7％,利用MEGA4.1软件计算滨珊瑚属基于ITS1和ITS2基因的平均遗传距离分别为0.097和0.200.基于ITS1和ITS2的NJ系统进化树都显示出,灰黑滨珊瑚位于进化树的基部,是原始的类群,普格滨珊瑚是进化类群,澄黄滨珊瑚是过渡类群.