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林木作为重要的自然资源，在生态、社会和经济建设中起着重要的作用，基因作图、基因测序、基因表达的系统分析以及DNA芯片等生物技术的应用为林木遗传机制的研究提供有利的工具，从而为林木新品种的培育提供更为有效的途径。笔者重点对林木结构基因组学、功能基因组学和蛋白质组学的主要研究内容、研究方法和研究进展三个方面进行综述，并对与林木基因组学研究密切相关的生物信息学进行阐述，最后对林木基因组学的发展进行简单展望。