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当代中国的学术自由与社会主义政治核心价值在改革实践中既有相对的区别，也有内在的联系。其相对区别表明：二者各具独特的内在规定、发展目标与实现机制，学术对于政治有相对的独立性。当代中国学术自由与社会主义政治核心价值在价值导向、现实作用、实现路径等方面的内在联系表明：在建设中国特色社会主义先进文化过程中，自由的学术研究尤其是自由的人文社会科学研究必须坚持社会主义政治核心价值体系的正确导向，使中国特色社会主义先进文化建设与民主政治建设协调发展。