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文章从国际视角对比分析了中国大陆2000-2010年间高校和科研机构的科研创新投入与产出能力状况。研究中发现,科研机构、中科院在研发资源方面优于高校,但高校的科技创新产出能力是科研机构的许多倍,但同国际同行比较,我国高校人均科技创新产出能力无论从质上和量上并不高。为了使中国高校科技创新能力有一个根本的提升,政府应该在加大对高校R&D经费的支持力度的前提下,改革现行的科研管理制度。