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为进一步了解系统投入-产出效率产生的原因、内部构成及各部分的贡献，基于两阶段数据包络分析（DEA）模型，构建同时优化投入和产出指标的两阶段组合DEA模型，证明该模型与其对偶模型之间的对应等价关系，并将该模型应用于规模报酬不变和规模报酬可变的情形．通过构建方向距离函数，该模型可等价为多目标线性规划（MOLP）模型．最后，通过算例验证了模型的有效性．