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利用2000-2014年安徽省区域自主创新的数据,运用DEA方法对安徽省自主创新过程中的知识创新和技术创新效率进行分析。结果表明：在2000-2014年期间,安徽省在知识创新阶段研究经费投入过大,处于严重的无效率状态。在技术创新领域处于规模收益递增阶段。最后提出适当加大知识创新人才的投入,减少知识创新经费投入,扩大技术创新规模,提高创新活动管理水平等建议。