"营改增"带来地税主体税种缺失,企业所得税和附税费流失,收入大幅减少,职能被弱化,征管模式面临重构。针对恩施州"营改增"带来的问题,具体如营业税相比增值税,占比高,四大行业新增增值税不能弥补营业税停收,导致"营改增"减税效应明显。划分比例变化,营业税下降50%的减收数大于增值税增长25%的增收数,又进一步导致地方财政减收。即使中央财政按2014年基数返还,也不能保证地方既有财力。缺乏高科技企业、服务类企业,一般纳税人规模小,抵扣专票难以取得,使得恩施州企业难以降低成本、形成完整抵扣链条。建议民族地区要建立政府主导的综合治税机制,加快特色产业的发展,开拓培育新税源。财政部门提高中央对地方税收返还基数,加大对民族地区的支持力度,将所得税的分享比例调整为中央与地方各50%;依靠顶层设计重构地方税收体系,改革调整地税部门税收征管方式,实行国地税无缝衔接。