【摘 要】
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为了解决传统基因调控网络构建算法准确度不高且效率低下的问题,使用一种基于微分方程的新型网络构建算法。算法分为奇异值分解和引力场算法两部分,奇异值分解策略用来缩小解空
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为了解决传统基因调控网络构建算法准确度不高且效率低下的问题,使用一种基于微分方程的新型网络构建算法。算法分为奇异值分解和引力场算法两部分,奇异值分解策略用来缩小解空间范围,提高运行效率。引力场算法是本文核心,共分初始化、解空间分解、移动算子和吸收算子4步骤。分解策略采用随机分组法,移动算子采用元素逐个移动法,并可根据收敛效果重新移动。最后,将本文算法与另两种启发式搜索算法下的网络构建进行比较,构建模拟和真实的基因调控网络。实验结果显示:本文算法具有更高的执行效率。
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