【摘 要】
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多序列比对是一种重要的生物信息学工具,在生物的进化分析以及蛋白质的结构预测方面有着积极的意义.以CLUSTAL W为代表的渐进式比对方法在此这个领域取得了很大的成功,但其固
【基金项目】
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国家重点基础研究发展计划(973计划)，国家自然科学基金，大连理工大学研究生院博士生联合培养计划资助，大连大学博士生联合培养资助
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多序列比对是一种重要的生物信息学工具,在生物的进化分析以及蛋白质的结构预测方面有着积极的意义.以CLUSTAL W为代表的渐进式比对方法在此这个领域取得了很大的成功,但其固有的缺陷阻碍了其比对精度的进一步提高.本文提出了一种基于小波包变换的多序列比对方法,这种方法利用小波包对数字信号良好的分析能力来寻找序列之间的相似片断,从而达到提高精度、降低计算量的作用.最后,本文利用多序列比对平台BAlisBASE和仿真程序ROSE,给出了此方法与其他比对算法的效率比较结果和讨论.
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