【摘 要】
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目的 构建炎症性肠病(IBD)肠道微生物整合代谢网络,比较分析IBD整合代谢网络的拓扑变化.方法参考KEGG数据库,根据肠道微生物参与的代谢反应构建整合代谢网络,用KO丰度差异abs
【机 构】
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温州医科大学附属台州医院,浙江台州 317000;台州恩泽医疗中心(集团)恩泽医院,浙江台州 318050;温州医科大学附属台州医院,浙江台州,317000;军事科学院军事医学研究院环境医学与作业医学
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目的 构建炎症性肠病(IBD)肠道微生物整合代谢网络,比较分析IBD整合代谢网络的拓扑变化.方法参考KEGG数据库,根据肠道微生物参与的代谢反应构建整合代谢网络,用KO丰度差异abs(log2 OR)评估KO与机体状态的关联,丰度差异>1的KO即为IBD相关KO,分析IBD相关KO与网络节点的介数中心度、聚类系数和度的关联,并比较IBD和健康整合代谢网络的模块化程度、稳定性和密度.结果构建了含1300个节点(KO)的整合代谢网络;发现366个KO与IBD相关(254个高表达,112个低表达);IBD相关的KO介数中心度和度显著小于IBD无关的KO,聚类系数显著大于IBD无关KO;IBD减少网络的模块化程度、稳定性和密度.结论IBD引起整合代谢网络拓扑属性的变化,IBD相关的KO倾向于在网络的边缘,整合代谢网络方法可从整体上解释肠道微生物变化与IBD的本质关联.
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