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DNA拓扑异构酶与断开DNA链和改变其拓扑结构有关。先前的研究认为，拓扑异构酶Type ⅡB 是由Type ⅡA通过基因的复制、重组和缺失所造成。然而，本研究结果则显示，TypeⅠA与TypeⅡB的进化关系较近，而TypeⅡA与TypeⅡB的关系较远。因此，TypeⅡB可能是由TypeⅠA演化而来，或者说，TypeⅡB是TypeⅠA在古细菌中的特化形式；TypeⅡB可能是由TypeⅡA通过形成TypeⅠA后演化而成的，而不是由TypeⅡA直接通过基因的复制、重组和缺失所造成。在由TypeⅡA演化成为Typ