【摘 要】
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目的:应用生物信息学方法,分析前列腺癌(PCa)中微小RNA(miRNA)的表达谱,构建miRNA-mRNA调控模型,预测PCa的关键靶基因(Hub-mRNA)。方法:下载肿瘤基因图谱(TCGA)数据库中PCa的
【机 构】
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广西医科大学第一附属医院,桂林医学院科学实验中心,广西疾病蛋白质组学研究重点实验室(培育)
【基金项目】
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广西卫生计生委科研基金资助项目(No.S2017034)。
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目的:应用生物信息学方法,分析前列腺癌(PCa)中微小RNA(miRNA)的表达谱,构建miRNA-mRNA调控模型,预测PCa的关键靶基因(Hub-mRNA)。方法:下载肿瘤基因图谱(TCGA)数据库中PCa的miRNA测序数据(miRNA-seq),使用R语言提取并分析差异表达miRNA(DE-miRNA)。预测miRNA的下游靶基因,进行GO功能注释以及KEGG信号通路富集分析。构建miRNA-mRNA调控网络鉴定关键靶基因,通过GEPIA分析Hub基因在PCa中的表达水平。结果:总共预测了20个上
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