听DNA讲述祖先的故事

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  无论是东方还是西方,人们对自己的祖先总是有许多美好的想象。西方人认为,他们的祖先是亚当和夏娃,他们因犯错被神驱逐到了人间,成为了人类祖先。在中国,天神伏羲和女娲是人类始祖的传说故事广为人知,伏羲和女娲是有史以来第一对夫妇,他们生育了人类,并教给人类各种生存技能。
  这些神话故事是不是真的呢?

DNA如何讲故事


  1987年,美国加州大学的生物学家瑞贝卡·卡恩和艾伦·威尔逊宣称他们找到了“夏娃”,她是一名来自15~20万年前的非洲女性,是全人类的“祖母”。
  2000年,美国斯坦福大学的生物学家昂德希尔找到了人类的“亚当”,全体人类男性的Y染色体基因全部来自6~9万年前非洲的一位“祖父”。
  2016年,复旦大学的生物学博士严实及其同事找到了六位中国人的“伏羲”,他们生活在约5000~6000年前,65%的现代中国人都是这六位超级祖父的后代。
  原来神话传说不都是骗人的?现今世界上几十亿的人类真的只由几位祖先繁育而来?等等,“夏娃”和“亚当”的年纪可相差了几万年,这又是怎么回事呢?

  这一切都要从DNA溯源说起。我们知道,DNA是父母在生育过程中传给子女的遗传物质,子女的DNA跟父母的DNA非常相似,根据两者DNA的相似度,很容易能判断他们的亲缘关系。那么,很多年前的始祖,他们在生殖的过程中也会给后代传递DNA,我们能不能从现代人类的基因组中找到那些最古老的DNA,进而找到始祖呢?这就是基因家谱学要解决的问题。
  一段DNA包含成千上万对碱基,当其中某一个碱基发生突变时,我们称之为单核苷酸多态性(SNP)。SNP在人体DNA中普遍存在,当祖先的DNA发生SNP时,它会被传递给后代,并且SNP发生过一次后要再过三千万代才会二次突变,因此我们发现两个人之间的SNP非常相似时,就说明他们有共同的祖先。
  另一种突变标记短串联重复序列(STR)与SNP连接在一起,就能指示SNP的发生时间。STR指的是一串在不同位置重复出现的特定的碱基,它每次发生突变都会随机地增加或减少一些碱基。而STR发生突变的速度是可知的,平均每经历一千个世代会有千分之一的STR发生突变,所以我们只要寻找到同一祖先的不同后代的STR最大的突变数,就可以推算出他们共同祖先的生活年代。
  举个例子,当两个网友要在现实中见面时,他们可能会这样说明自己的位置,“广场上有个狮子雕像,从那里往右边走十步就能看到我”。在基因家谱学中,SNP就相当于狮子雕像,STR就是右走十步,我们得在现代人的DNA中找到一些始祖传下来的DNA,再去判断这些始祖DNA的具体年代,这样才能最终定位到始祖。

DNA故事选着听


  当然,找到始祖SNP听起来很容易,但僅仅一个人的DNA中可能就有百万个SNP,这是他的历代祖先一代代传递下来的,如何从海量的SNP中找到始祖传递下来的SNP呢?遗传学家们会这样缩小范围,只找祖父一脉或祖母一脉传下来的DNA,这样能减少一半的工作量。
  Y染色体是人类区分性别的染色体,含有Y染色体的为男性,不含Y染色体的为女性,因此Y染色体只能由父亲传给儿子。所以Y染色体上的DNA出现SNP时,只会是“祖父”传下来的,从Y染色体上找“祖父”会简单得多。
  “祖母”该如何找呢?并不能从另一条性染色体——X染色体上找,因为男性和女性体内都含有X染色体,父母双方都能将自己的X染色体传给子女,X染色体的变化同样很难追踪。追踪“祖母”靠的是研究线粒体DNA(mtDNA)的变化。
  线粒体存在于细胞质中,它也携带有一些DNA。受精卵形成时,细胞质全部由卵细胞提供,因此孩子的mtDNA只来自于母亲,只有传给女儿的mtDNA才能继续传承下去,可以说mtDNA在女性中就如同Y染色体在男性中的存在。这让“祖母”的溯源有了方向。
  上述的研究正是分别从母系DNA和父系DNA中溯源得到的结论,如果计算没有出错的话,可信程度是非常高的。这告诉我们,史前不远的时代,世界上确实有几个超级祖先,绝大多数的现代人类都是他们的后代,也就是说,亚当和夏娃、伏羲和女娲确实是有其原型的,只不过其重要程度被夸大了。
  看到这里,也许你还有一个疑问没解答,那就是“始祖父母”的年龄差怎么会这么大呢?那是因为,他们并不是真正的夫妻,甚至不是同一辈人。始祖母的女性后代在优胜劣汰的过程中占据了上风,其他的女性全部湮灭在历史长河中,唯有她的DNA传承了下来。后来,始祖母的某一位后代遇上了始祖父,他们诞下的后代最终发展壮大成了现今的人类。

DNA的新故事


  除了讲述始祖的神话故事,古DNA还能给我们讲一些八卦故事,例如某些名人家族的爱恨情仇和家庭纠纷。
曹操复原图

  曹操是三国时期最大的国家魏的开国君王,他一生中南征北战,统一了中国北方。夏侯家族是曹操门下最得力的武将家族,为了巩固关系,两家常常相互通婚,夏侯家主娶了曹操的小姨子,曹操又将女儿嫁给了夏侯家的儿子。曹操的政敌吴国人为了丑化曹操,写了一本书叫《曹瞒传》,书中说曹操的父亲曹嵩原本是夏侯家的后代,以此讽刺他们家族乱伦。这是不是真的呢?
  2009~2013年,复旦大学历史学和人类学联合课题组一直在进行曹操家族的DNA研究,希望能揭示曹操家族的亲缘关系。学者们采集了许多可能是曹操后人的男性志愿者的血液样本,包括曹姓家族的280名男性和夏侯、操等姓氏的其他男性,共1000个左右的样本,绘制了他们的基因图谱。在真正的曹操的男性后代的Y染色体上,学者们找到了一类非常独特的SNP,它非常罕见,在其他家族的男性身上出现的概率只有千万分之三。而且据测算,这类SNP在1800年前就已经存在了,那时正是曹操生活的年代,因此可以作为曹操家族寻祖的标志。
  接着,学者们在安徽亳州的曹氏宗族墓中找到了曹操叔祖父曹鼎的尸骨,从他的牙齿中提取了DNA,也同样找到了上述独特的SNP。这证明了曹操的直系后代与曹操叔祖父有同样的基因类型,他们拥有共同的祖先,而与夏侯家族并没有关系。根据史书记载,曹操的父亲确实是养子,这说明曹操的父亲最可能是其祖父从其他兄弟处过继来的。至此,曹操的身世之谜终于真相大白了。
  除了曹操,古今中外还有许多扑朔迷离的家庭伦理故事,比如法国皇帝拿破仑和波旁家族的真正关系、谁是中国清朝“第一家族”爱新觉罗家族的真正后人等,基因家谱学将能真正揭开这些故事背后的真相。
  未来,我们还能在古DNA中读出什么故事呢?
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