【摘 要】
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目的:探讨模型小鼠肝细胞癌组织(TM)内差异表达的外泌体来源RNA剪接基因(exosome-derived RNAsplicing-related DEGs,ERDs)的变化图谱及AS、SNV和INDEL与基因表达的关系。方
【机 构】
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右江民族医学院生物化学与分子生物学教研室
【基金项目】
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广西自然科学基金项目(2016GXNSFAA380177和2015 GXNSFAA139219),广西自治区级大学生创新创业训练计划项目(NO.201810599050和NO.201810599039),广西研究生教育创新计划项目(NO:JGY2020164)
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目的:探讨模型小鼠肝细胞癌组织(TM)内差异表达的外泌体来源RNA剪接基因(exosome-derived RNAsplicing-related DEGs,ERDs)的变化图谱及AS、SNV和INDEL与基因表达的关系。方法:以健康小鼠肝组织(生理微环境,PM)、模型小鼠无瘤体肝组织(细胞癌前微环境,PTM)和模型小鼠肝细胞癌组织(肿瘤微环境,TM)为材料,分别提取各组样本中的总RNA进行RNA-seq和生物信息学分析,并通过RT-qPCR验证实验结果。结果:与PTM比较,TM中有158个高表达的ERD
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