目的了解新疆军区总医院血流感染金黄色葡萄球菌临床分离株的分子特征,检测毒力基因携带情况及其对临床常用抗菌药物的耐药性。方法收集2012-2016年新疆军区总医院不同血流感染患者分离的53株金黄色葡萄球菌,应用聚合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction,PCR)鉴定甲氧西林耐药性;应用SCCmec分型、spa分型、多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST)等分子分型方法对金黄色葡萄球菌进行分析,PCR检测pvl等21种毒力基因,分析不同克隆毒力基因携带情况,观察菌株对临床常用抗菌药物的耐药性。结果 53株金黄色葡萄球菌中30株为耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(methicillin-resistant Staphylococcus aureus,MRSA),23株为甲氧西林敏感金黄色葡萄球菌(methicillin-susceptible Staphylococcus aureus,MSSA)。30株MRSA菌分为4种ST型和4种spa型,3种SCCmec型,优势流行克隆为MRSA-ST239-t030-SCCmecⅢ占90.0%(27/30)同时鉴定出3株社区获得性MRSA。23株MSSA鉴定出10种ST型、14种spa型,主要流行克隆为ST22-t309,检出4株动物源性的克隆ST398。所有菌株中均检测到hla及hld两种溶血素基因,ST239克隆均携带有sea,see,hla,hld以及hlg-2基因,少量菌株还携带有pvl,sed等基因。ST22克隆则携带有包括pvl,seg等8种毒力基因。MRSA菌株对常用抗菌药物呈现高度耐药,MSSA菌株对青霉素、红霉素的耐药率分别为91.3%和69.6%,对其他抗菌药物敏感。结论引起新疆军区总医院血流感染主要MRSA克隆为MRSAST239-t030-SCCmecⅢ,对抗菌药物耐药程度较高;主要MSSA克隆为ST22-t309,携带较多毒力基因,具有高毒力。