【摘 要】
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在植物中Orange(Or)蛋白对类胡萝卜素的生物合成和积累具有重要的作用.对胡萝卜全基因组分析后鉴定到3个Or基因,为分析3个Or基因与类胡萝卜素合成的相关性,以橙色胡萝卜品种黑田五寸为研究材料,克隆得到3个Or基因,并对其进行生物信息学分析及实时荧光定量(qRT-PCR)分析.序列分析表明,DcOr1、DcOr2和DcOr3的开放阅读框(ORF)全长分别为933、858和939 bp,分别编码310、285和312个氨基酸;推测的氨基酸序列含有4个高度保守的富含半胱氨酸区域.DcOr1和DcOr3均由
【机 构】
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南京农业大学园艺学院,江苏南京 210095
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在植物中Orange(Or)蛋白对类胡萝卜素的生物合成和积累具有重要的作用.对胡萝卜全基因组分析后鉴定到3个Or基因,为分析3个Or基因与类胡萝卜素合成的相关性,以橙色胡萝卜品种黑田五寸为研究材料,克隆得到3个Or基因,并对其进行生物信息学分析及实时荧光定量(qRT-PCR)分析.序列分析表明,DcOr1、DcOr2和DcOr3的开放阅读框(ORF)全长分别为933、858和939 bp,分别编码310、285和312个氨基酸;推测的氨基酸序列含有4个高度保守的富含半胱氨酸区域.DcOr1和DcOr3均由8个外显子和7个内含子组成,DcOr2由7个外显子和6个内含子组成.进化树分析显示,DcOr1与DcOr2进化关系最近,而DcOr3与三裂叶薯Or蛋白(XP_031112030.1)进化关系最近.qRT-PCR结果表明,3个DcOr基因在30、60、90和120 d的胡萝卜根中均有表达,其中DcOr2的相对表达量最低,DcOr3在各个阶段的相对表达量都为最高,在90 d时达到峰值,且相对表达量趋势与DcPSY1和DcPSY2最接近,推测DcOr3与胡萝卜类胡萝卜素合成最相关.本研究为探究胡萝卜生长发育过程中类胡萝卜素的生物合成机制提供了一定的理论依据.
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