【摘 要】
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为了解禽流感病毒（AIV）在野禽和家禽之间的传播特点，本研究于2020年3月～2021年3月在野生鸟类资源丰富的拉市海国际高原湿地采集到野鸟粪便样品1 367份、家禽泄殖腔拭子420份和环境水样20份，共计1 807份样品，通过鸡胚接种和RT-PCR分离鉴定出1株斑头雁来源的H9N2 AIV和2株家禽来源的H9N2 AIV。利用Illumina Miseq测序平台获得3株分离病毒的全基因组序列，并
【机 构】
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西南林业大学生命科学学院/国家高原湿地研究中心
【基金项目】
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云南国际性高原湿地迁徙型涉禽禽流感等动物疫病监测研究（1963037）； 云贵高原越冬斑头雁迁徙通道和空间活动模式研究（32060120）；
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为了解禽流感病毒（AIV）在野禽和家禽之间的传播特点，本研究于2020年3月～2021年3月在野生鸟类资源丰富的拉市海国际高原湿地采集到野鸟粪便样品1 367份、家禽泄殖腔拭子420份和环境水样20份，共计1 807份样品，通过鸡胚接种和RT-PCR分离鉴定出1株斑头雁来源的H9N2 AIV和2株家禽来源的H9N2 AIV。利用Illumina Miseq测序平台获得3株分离病毒的全基因组序列，并构建了其遗传进化树，分析了与流感病毒的传播能力及致病力相关的关键氨基酸位点的特征。遗传进化分析结果显示，野禽源和家禽源AIV具有相同的遗传进化特征：3株H9N2 AIV均属于欧亚谱系h9.4.2.5分支的病毒，其HA、NA基因为Y280-like亚群，PB2、M基因为G1-like亚群，PB1、PA、NP和NS基因为F/98-like亚群，推测3株分离株均为重组病毒，重组模式为中国流行的H9N2 AIV S基因型。氨基酸位点分析结果显示，3株分离病毒HA、NA、PB2、PB1、M1和NS1蛋白的突变位点均与病毒跨种属传播能力和小鼠致病力增强相关；同时野禽源H9N2 AIV同样存在家禽源分离株相似的HA蛋白N166D替换和NA蛋白颈部aa63～aa65位点缺失，但PA蛋白中未发生N383D突变。以上结果表明，本研究中野禽源H9N2 AIV可能源于家禽的传播，病毒在自然宿主野禽中发生了适应性突变。本研究首次对拉市海高原湿地野禽源与家禽源H9N2 AIV的遗传变异特征进行了系统分析，为禽流感的综合防控提供基础数据。
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