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目的：对本地区柯萨奇病毒A16型（Cox A16）进行监测。方法：对42例手足口病患者的咽拭子、粪便采用实时荧光RT-PCR检测方法式进行检测。结果：查出6例柯萨奇病毒A16型感染。幼儿园适龄儿童为Cox A16高危人群,4～8月为发病高峰期。结论：通过对柯萨奇病毒A16型进行监测,可实行早发现、早诊断,避免疾病爆发流行。