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提出一种新型的基于复式正方晶格的光子晶体太赫兹（THz）双波长滤波器，该滤波器利用线缺陷作为波导、点缺陷作为微腔来实现双频率选择功能。应用平面波法（PWM）分析其带隙结构，应用时域有限差分法（FDTD）研究THz波在该滤波器中的传输特性。结果表明，采用复式晶格结构的THz滤波器，可以通过一个点缺陷实现两个波长的选择，通过在点缺陷处填充非线性介质砷化镓（GaAs）和增大某些介质柱的半径，可使该滤波器实现高耦合效率的单信道双频率选频滤波功能，该滤波器具有插入损耗小、信道隔离度大、时间响应快等优点。