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为推动国民经济和区域经济的发展,政府投资项目越来越普遍,因此就需要对政府投资项目绩效进行评价。文章首先运用定量与定性相结合的方法,构建了政府投资项目绩效评价指标体系,其次基于数据包络分析法和德尔菲法构建了DEDM评价方法,不仅提高了专家评价的准确度,而且将非量化指标量化,为包含客观指标数据及主观评价因素的复杂绩效综合评价提供了新研究思路。最后以出入境检验检疫系统的8个实验室为例,给出数值算例,运用该方法进行综合评价,并验证该方法的可行性及实用性。