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《化学信息学》作为化学、化工和材料类专业的必修课程在大学化学教学中有着重要的意义。随着计算机信息技术和网络技求的发展，《化学信息学》的教学内容不断更新，随着时代的发展，教学对象也在不断变化，这门课程的教学面临的挑战越来越大。《化学信息学》是一门培养学生实践能力的学科，对学生的自主学习能力的培养是该课程的重要教学目标之一。本论文提出了新环境下高校化学信息学课程自主学习与协作学习相结合的教学模式，阐述了实施该教学模式的理论依据、要素和操作流程，介绍了教学过程中部分教学内容的教学实例。