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目的
探讨神经管缺陷(NTDs)家系中全基因组DNA甲基化改变情况及其意义。
方法收集3个NTDs家系，共12例研究对象纳入本研究，以NTDs患者作为病例组，家系中表型正常的成员为对照组。抽取12例研究对象的外周血，提取基因组DNA。使用重亚硫酸盐处理基因组DNA，全基因组扩增方式扩增片段化，置Illumina Infinium人类甲基化450k芯片上，进行杂交、洗脱、延伸、成像，使用iScan软件扫描芯片，Genome Studio读取扫描图像结果。使用Illumina甲基化分析器软件进行数据分析。
结果基因差异甲基化分析显示：差异性甲基化基因位点仅占检出CpG位点的0.2%，617个差异性DNA高甲基化的位点(P<0.05)，其中63个DNA甲基化位点P<1×10－4，包括E盒结合锌指蛋白2基因、5，10－亚甲基四氢叶酸脱氢酶1基因等；104个差异性DNA低甲基化的位点(P<0.05)，其中65个DNA甲基化位点P<0.01，包括同源异型盒B7基因、runt相关的转录因子3基因等。聚类分析显示：NTDs患儿呈DNA高甲基化改变的趋势较一致，而对照组呈DNA低甲基化改变的趋势较一致。
结论在NTDs家系中，DNA甲基化异常可能是NTDs发生的危险因素之一。