2013-2018年新乡市甲型H1N1流感病毒流行特征和基因进化分析

来源 :中国病毒病杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:haobs
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目的分析新乡市2013年1月至2018年3月甲型H1N1流感病毒的流行和基因进化特征,了解新乡市甲型H1N1流感病毒的变异情况。方法采用描述性统计学方法对新乡市甲型H1N1流感病毒核酸阳性结果进行分析;随机抽取不同时间分离的20株病毒进行血凝素(hemagglutinin,HA)和神经氨酸酶(neuraminidase,NA)基因测序,使用DNAman软件进行核苷酸和氨基酸序列比对,采用邻接法(neighbor-joining method,NJ)法进行进化树分析。结果 2013-2017年新乡市甲型H1N1流感呈低流行态势,2018年初成为优势流行株,主要感染0~15岁人群(123/150,82.0%)。新乡市分离株与同期疫苗株HA基因核苷酸和氨基酸同源性分别为96.65%~98.47%和96.64%~99.29%,NA基因核苷酸和氨基酸同源性分别为97.56%~99.22%和96.59%~99.19%。新乡流行株HA基因分属2个进化分支;2013-2017年初的流行株与同期疫苗株相比出现多处变异,其中2016-2017年初的毒株同时出现抗原位点Sa区S162N、K163Q、Sb区S185T和Ca区S203T变异。NA基因进化树与HA结果对应,2013-2017年初的流行株NA基因有16处氨基酸突变;95%的毒株糖基化位点有8个,分别是第42、50、58、63、68、88、146和235位。结论 2013-2018年新乡市传播的甲型H1N1流感病毒株发生了一定程度的变异,2017-2018年国际推荐的新的疫苗株更适用于当前流行株,但仍需加强监测。
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