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目的
探讨以反相蛋白阵列技术(RPPA)筛选并验证肝细胞癌(HCC)患者预后相关分子标志物的可行性。
方法收集2017年12月前癌症基因图谱计划(TCGA)数据库中所有可公开获取的HCC样本RPPA数据和相关资料,单因素及多因素Cox回归分析HCC患者预后相关目标蛋白。收集2013年1月至2014年1月川北医学院附属医院121例HCC患者资料,检测RPPA数据筛选出的预后相关蛋白表达情况,并分析其与预后的关系。
结果在218种受检测蛋白中23种与预后相关。多因素Cox回归分析,NOTCH1(HR=1.515,95%CI:1.287~1.845,P<0.05)及AKT1高表达(HR=1.119,95%CI:1.033~1.203,P<0.05)增加患者死亡风险,NF2高表达(HR=0.865,95%CI:0.783~0.956,P<0.05)降低患者死亡风险。上述三种蛋白高表达与低表达患者总体生存率比较,差异有统计学意义(P<0.05)。纳入的临床患者资料分析也提示NOTCH1、AKT1及NF2在患者的HCC及癌旁组织中表达存在明显差异。进一步的生存分析提示高表达NOTCH1、AKT1与患者不良预后显著相关。NF2的表达与预后有一定关联,但差异无统计学意义(P>0.05)。
结论RPPA作为一种高通量的蛋白表达定量技术,可用于HCC预后标志物的筛选,且筛选结果总体上可信度较高。