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基于孵化周期,提出一种动态评估宏观科技企业孵化器系统创新效能的度量指标。以2008年至2014年中国国家级科技企业孵化器为样本,使用时间序列模型,实证评估宏观科技企业孵化器系统的创新形势。实证结果显示,宏观科技企业孵化器系统的创新输出与孵化周期有着密切联系,其总体创新效能还将进一步提升。