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关于益生菌的许多基础研究工作需要加强,如解决如何使活菌进入消化道后,能够使大多数菌群经受盐酸、胆汁酸的作用的问题,提高菌种耐受力;解决有益微生物生长慢,难以在与其他微生物间竞争中处于优势地位的问题;解决不同动物种类、年龄、生理状态对益生菌作用有不同影响的问题等,为筛选功效更为确实、作用机制清楚的益生菌提供理论基础。