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噬菌体展示技术已被广泛地应用于生物学研究的各个方面，利用它可融合表达多肽，蛋白质结构域和蛋白质，尤其是多肽噬菌体展示，已被作为一种便利的研究工具去发现和研究那些与受体酶、凝集素，抗体、核酸以及其他生物分子亲和的多肽配基和酶的底物专一性，该技术在药物的发现，疫苗的设计等医学院领域也有着潜在的应用价值。