目的:探讨用蛋白质芯片技术筛选多囊卵巢综合征(polycysticovarysyndrome,PCOS)患者血清蛋白质表达谱,寻找血清中的标志性蛋白。方法:采用表面增强激光解离飞行时间质谱技术(surfaceenhancedlaserdesorption/ionizationtimeofflightmassspectrometry,SELDITOFMS),运用WCX2(weakcationexchange)蛋白质芯片检测31例PCOS患者和30例正常对照血清蛋白质谱,获得的蛋白质谱采用BiomarkerWizard软件分析,初步筛选蛋白质峰,结合生物信息学的支持向量机(supportvectormachines,SVM)方法建立并测试PCOS患者的蛋白质指纹图谱模型。结果:在芯片上捕获到225种蛋白质,用质谱仪筛选出PCOS患者与正常对照组相比的23种差异蛋白,从中再次筛选出4种蛋白质组成PCOS的蛋白质谱最优化模型,PCOS患者中质荷比(m/z)分别为6628,6430,6834的3种蛋白质表达上调,m/z为3954的蛋白质表达下调。模型经三倍交叉验证后用盲法测定,其敏感性和特异性分别为83.3%和86.7%,阳性预测值为87.2%。结论:蛋白质芯片技术可以快速、有效地筛选出PCOS患者血清差异蛋白,结合SVM可建立一个由4种蛋白质组成的蛋白质指纹图谱模型,可对PCOS做很好的诊断预测,对这4种蛋白质尤其是m/z为6628的蛋白质进行研究,有助于PCOS病因学进展及诊断标记物的发现。