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目的 了解佛山市南海区手足口病病原体型别及其流行特征,为手足口病疫情防控工作提供参考依据.方法 2015-2018年每年的4-8月在哨点医院收集手足口病病例粪便标本,采用荧光定量RT-PCR方法对标本进行肠道病毒(enterovirus,EV)71型,柯萨奇病毒A组16型(coxsackievirus A16,CVA16)、6型(coxsackievirus A6,CVA6)、10型(coxsackievirus A10,CVA10)核酸检测,并分析各型肠道病毒检出率的时间分布、男女性别及年龄组差异.结果 共收集435份粪便标本,阳性385份,阳性率为88.51％,EV 71、CVA16、CVA6、CVA10检出率分别为8.97％、18.16％、40.00％、11.26％,其他肠道病毒(未分型)检出率为9.43％,混合感染阳性率为0.69％.连续4年4～8月肠道病毒检出率分别为95.28％、80.20％、89.09％、88.98％,差异有统计学意义(x2=11.702,P＜0.01),2015、2017年CVA6检出率最高(66.98％、63.64％);2016、2018年CVA16检出率最高(37.62％、31.36％).男女性别差异在手足口病病原检出率上差异无统计学意义.除总肠道病毒、CVA10在各年龄组检出率差异无统计学意义外(x2EV=8.514,x2CVA 10=5.636,P＞0.05),其他病原型检出率差异均有统计学意义(x2EV 71=14.258,x2CVA 16-25.587,xCVA 6=17.581,x2未分型17.743,P＜0.05).2岁内幼儿CVA6检出率最高(46.59％),3-4岁组EV 71检出率最高(21.57％),4-5岁组CVA16检出率最高(38.89％),其他未分型检出率在5岁以上组最高(31.25％).与EV 71、CVA16相比,CVA6更易感染年龄偏小儿童.2018年肠道病毒各型检出率时间分布较其他年份明显改变,CVA10检出率明显增高.结论 2015-2018年佛山市南海区手足口病病原以CVA6和CVA16为主,隔年交替出现高峰,各年龄组中不同型肠道病毒检出率存在差异.