论文部分内容阅读
在蛋白质天然构象预测中，折叠识别法中一致性预测Pcons2和从头预测法中的Rosetta在CASP5中获得了很大的成功。在Rosetta法中，先用Monte Carlo搜索法产生大量低能量的预测模型，然后依据模型之间相似性分数，用聚类分析法选择质量好的模型，而Pcons2则是基于线性回归来预测模型的质量。人们通常认为Pcons2和聚类分析是两个完全不同的方法．本文通过理论研究和实际数据计算发现：在聚类分析中，模型之间的相似性分数与模型质量存在着较强的线性关系，这也是聚类分析的工作基础。因此，如果不考虑预测