【摘 要】
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基于溶组织内阿米巴感染后的基因表达谱(GSE23750),利用R语言、DAVID及STRING等生物信息学方法进行差异表达、功能富集及网络互作的分析.共获得207个差异基因,其中上调基因125个、下调基因82个.差异基因的功能主要是富集参与免疫反应的中性粒细胞活化、体液免疫应答、对细菌来源分子的反应等.最后通过cytoscape插件筛选出核心基因PTGS2、MMP1、MMP2、MMP10及SERPINE1.该分析将为阿米巴痢疾的治疗与预防提供新的靶点及研究思路.
【机 构】
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贵州医科大学 寄生虫学教研室,贵州贵阳 550001
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基于溶组织内阿米巴感染后的基因表达谱(GSE23750),利用R语言、DAVID及STRING等生物信息学方法进行差异表达、功能富集及网络互作的分析.共获得207个差异基因,其中上调基因125个、下调基因82个.差异基因的功能主要是富集参与免疫反应的中性粒细胞活化、体液免疫应答、对细菌来源分子的反应等.最后通过cytoscape插件筛选出核心基因PTGS2、MMP1、MMP2、MMP10及SERPINE1.该分析将为阿米巴痢疾的治疗与预防提供新的靶点及研究思路.
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