Extensive profiling of the expressions of tRNAs and tRNA-derived fragments (tRFs) reveals the comple

来源 :中国科学:生命科学(英文版) | 被引量 : 0次 | 上传用户:l_zhanghk
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
Evidence is emerging that tRNA-derived fragments (tRFs) are regulatory molecules.Studies of tRFs in plants have been based on conventional small RNA sequencing,and focused on profiling of tRF-5 and tRF-3 species.A more comprehensive and quantitative analysis of the entire tRF population is highly necessary.Here,we employ tRNA-seq and YAMAT-seq,and develop a bioinformaties tool to comprehensively profile the expressions of tRNAs and tRFs in plants.We show that in Arabidopsis,approximately half of tRNA genes are extremely weakly expressed,accounting for only 1% of total tRNA abundance,while ~12% of tRNA genes contribute to ~80% of tRNA abundance.Our tRNA sequencings in various plants reveal that tRNA expression profiles exhibit a cross-species conserved pattern.By characterizing the composition of a highly heterogeneous tRF population,we show that tRNA halves and previously unnoticed 10-16-nt tiny tRFs represent substantial portions.The highly accumulated 13-nt and 16-nt tiny tRFs in Arabidopsis indicate that tiny tRFs are not random tRNA degradation products.Finally,we provide a user-friendly database for displaying the dynamic spatiotemporal expressions of tRNAs and tRFs in the model plants Arabidopsis and rice.
其他文献
初中作为承接小学和高中的阶段,是培养学生良好数学学习习惯、提升学生数学核心素养的重要时期.其中,学生解题能力强弱是其数学素养程度高低的一个重要体现.因此,教师应该针
常微分方程作为数学教学中的主要知识点,通过高效的教学方法与学习方法可以实现理想的效果。但是,教师在教学实践过程中需要根据多样化的培养目标对教学方法进行适当调整与完善。本文从培养学生数学推理能力入手,讨论利用常微分方程教学思维来培养高中生数学推理能力的策略。
Let M be a type Ⅱ1 factor,G be a finite group,and N ? M be an irreducible subfactor of finite index.We prove that the composed lattice of the intermediate subf
本文以培养学生的数学学习兴趣为主题展开论述,首先分析了培养学生数学学习兴趣的重要性,之后重点探讨了学生数学学习兴趣的培养策略。
The Onsager-Machlup(OM)functional is well known for characterizing the most probable transition path of a diffusion process with non-vanishing noise.However,it
核心素养是学生学习必需具备的能力和品格,是推动学生整体发展的前提。为此,本文针对初三化学教学中学生核心素养培养的基本思路、路径、策略展开相关探讨与分析。
碳中和是应对气候变化的必由之路,海洋负排放是实现碳中和的重要途径.文章提出海洋负排放相关的八个基本路径,包括陆海统筹减排增汇、海洋缺氧酸化环境减排增汇、滨海湿地减排增汇、养殖环境减排增汇、珊瑚礁生态系统减排增汇、海洋地质碳封存、海洋碳汇核查技术体系,以及海洋碳汇交易体系和量化生态补偿机制等;旨在抛砖引玉,引发研讨、推动研发,不断细化和完善海洋负排放方案,为落实碳中和国家战略提供科技支撑.
英语绘本作为新生代所衍生的重要教学辅助工具,在英语教学中的作用不容忽视,也是学生扎实掌握英语知识,提升学生英语阅读能力的重要路径.本文就小学英语教学中绘本的应用进行
农村小规模学校由于自身条件的影响,在阅读课程开展方面一直都没有取得一个较为良好的效果.学生的阅读能力不强,导致学生在后续学习过程中出现一系列的问题.在素质教育推进的
在小学阶段,学生虽然好奇心强烈,但是他们对如何学习和探索还缺乏一定的认知.本文就如何培养小学生的问题意识作出了探究.