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第一个被选择用于表达外源蛋白的是酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae），人们对其基因操作和生物学特性比较了解，长期用于发酵的经验也显示其安全可靠。然而实践证明，酿酒酵母表达系统也有其局限性，如缺乏强有力的启动子、分泌效率差、表达菌株不够稳定、表达质粒易于丢失等，也不是理想的外源基因表达宿主。鉴于此，20世纪80-90年代人们又发展了一个真核高效表达系统——巴斯德毕赤酵母表达系统。巴斯德毕赤酵母是一种嗜甲基酵母，可以在以甲醇为唯一碳源和能源的培养基中快速生长。由于其在蛋白质表达方面具有