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菊苣EST-SSR分子标记开发及通用性分析

来源 :草地学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：lanshi2008

【摘 要】

：

为了开发菊苣(Cichorium intybus)简单重复序列(Simple sequence repeat,SSR)分子标记,采用菊苣表达序列标签(Expressed sequence tags,EST)序列设计EST-SSR引物,并验证引物的有效性和通用性。结果表明:菊苣EST序列中共搜索到648个SSR位点,146种重复基序,SSR出现频率为1.61%;三核苷酸重复类型最多(46.45%),TC/GA基序出现频率最高(14.35%);152对EST-SSR引物在菊苣中的有效扩增率和多态率分别为78.

【作 者】

：

梁小玉 季杨 胡远彬 易军 白史且 张靓 张新全 

【机 构】

：

四川省畜牧科学研究院,四川农业大学动物科技学院,四川省林业和草原局

【出 处】

：

草地学报

【发表日期】

：

2021年9期

【关键词】

：

菊苣 EST-SSR分子标记 信息分析 遗传多样性 通用性 

【基金项目】

：

四川省科技计划项目(2021YFYZ0013-4),四川省现代畜牧业发展类项目(SASA2021CZYX003)资助。

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为了开发菊苣(Cichorium intybus)简单重复序列(Simple sequence repeat,SSR)分子标记,采用菊苣表达序列标签(Expressed sequence tags,EST)序列设计EST-SSR引物,并验证引物的有效性和通用性。结果表明:菊苣EST序列中共搜索到648个SSR位点,146种重复基序,SSR出现频率为1.61%;三核苷酸重复类型最多(46.45%),TC/GA基序出现频率最高(14.35%);152对EST-SSR引物在菊苣中的有效扩增率和多态率分别为78.

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