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小陇山林区植物种类丰富,有13个植被类型,89个群系,区内国家重点保护野生植物呈散生、零星或团块状分布,地域分布广,种群数量少,尚未形成商品性开发利用。现阶段只采取就地、迁地保护措施,保护力度不大、规模偏小。目前已批的迁地保护基地1个,就地保护基地2个。水楸、欧洲云杉等树种只有小面积人工培植。