干旱耐受型和敏感型玉米应答干旱的比较转录组学分析

来源 :西北农林科技大学学报:自然科学版 | 被引量 : 0次 | 上传用户:kaixinlfy
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[目的]比较分析干旱耐受型(Han21)和敏感型(B73)玉米自交系响应干旱胁迫的转录组数据,为理解玉米应答干旱胁迫的分子机制提供依据。[方法]利用高通量测序技术获得Han21、B73在正常和干旱条件下的转录组,随后利用一系列生物信息学方法进行转录组数据质控(FastQC)、测序数据与基因组的序列比对(HISAT2)、基因表达定量分析(StringTie)、差异表达分析(edgeR)、转录本转换事件分析(deepTS)以及基因功能富集分析(topGO)。[结果]B73和Han21玉米自交系在正常和干旱条件
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