【摘 要】
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目的 建立RNA病毒基因组的从头测序方法,验证高通量测序平台同时测定不同RNA病毒基因组序列的能力.方法 选取日常监测工作中分离的一株EV71毒株和一株季节性流感病毒,提取病
【机 构】
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福建省人兽共患病研究重点实验室(福建省疾病预防控制中心)
【基金项目】
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国家科技重大专项项目(2012ZX10004-210)、福建医学创新课题(2012-CXB-13)资助
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目的 建立RNA病毒基因组的从头测序方法,验证高通量测序平台同时测定不同RNA病毒基因组序列的能力.方法 选取日常监测工作中分离的一株EV71毒株和一株季节性流感病毒,提取病毒RNA,制备测序文库,按标准步骤在GS Junior完成测序反应,分析数据.结果 共得到超过14万序列片段,总计46.9M碱基,平均读长334 bp.初步拼接可以得到914个片段(contig),而以相应参考毒株基因组为标准,一次反应得到EV71全长基因组的99.84%及流感病毒的96.7%.结论 高通量测序仪能够同时快速、准确地从
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