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目的：探讨广东省医学科研发展情况。方法：比较分析1999—2008年SCI收录广东与北京、上海、江苏、浙江和山东5省市医学论文数量、学科构成和被引频次。结果：广东省医学论文总数排第3名，且低于6省市的平均水平。广东医学论文的学科构成与山东相似，与其余4省市差异较大，眼科学、泌尿外科学和肾脏病学为广东的优势学科。广东医学论文的平均被引频次依然排名第3，且低于6省市的平均水平。结论：目前广东省医学科研发展情况在6省市中处于尴尬地位，广东有必要咖大科研的投入力度，激励科研人员的创新热情，在发展优势学科的同时，有