NaCl胁迫下红砂种子萌动期差异表达基因的转录组分析

来源 :南京林业大学学报(自然科学版) | 被引量 : 0次 | 上传用户:jason31906
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【目的】筛选NaCl胁迫下,红砂萌发期差异表达基因,为耐盐碱树种选育提供基因资源。【方法】以前期拟合的萌发阈值浓度(273 mmol/L标记为M),最适萌发浓度(43 mmol/L标记为L)、蒸馏水(标记为C)处理红砂种子,每个处理3次重复,待胚根突破种皮,不超过2 mm时取出,进行转录组测序。【结果】分别在L与C对比组(记为LvsC)、M与C对比组(记为MvsC)、M与L对比组(记为:MvsL)中筛选出210、2 273、2 888个差异表达基因,其中LvsC中116个表达上调,94个下调表达;MvsC中1 781个上调表达,492个下调表达;MvsL中2 165个上调表达,723个下调表达;上调表达基因在KEGG富集中主要集中在核糖体、碳代谢、细胞色素P450代谢、谷胱甘肽代谢等途径,下调表达基因主要富集在蔗糖淀粉代谢、内质网蛋白质加工等过程。【结论】胁迫条件下,差异基因诱导相关反应协同发挥作用,最终使胚轴细胞伸长,突破种皮完成萌发。
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