【摘 要】
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目的 利用TCGA数据库分析NADPH氧化酶NOX家族基因在肾透明细胞癌(ccRCC)中表达的临床意义.方法 收集TCGA数据库肾透明细胞癌数据集(TCGA-KIRC)中NADPH氧化酶NOX家族基因NOX1-5和DUOX1-2mRNA表达谱资料及临床病例资料.通过Cox回归模型、K-M曲线log-rank检验分析NADPH氧化酶NOX家族基因表达的预后意义,通过卡方检验分析NOX家族基因与ccRCC患者临床病例参数的相关性.采用基因集富集分析(GSEA)方法探讨NOX家族基因调控ccRCC可能的作用机制
【机 构】
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中国医科大学肿瘤医院辽宁省肿瘤医院检验科,辽宁沈阳,110042;中国医科大学肿瘤医院辽宁省肿瘤医院泌尿外科,辽宁沈阳,110042
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目的 利用TCGA数据库分析NADPH氧化酶NOX家族基因在肾透明细胞癌(ccRCC)中表达的临床意义.方法 收集TCGA数据库肾透明细胞癌数据集(TCGA-KIRC)中NADPH氧化酶NOX家族基因NOX1-5和DUOX1-2mRNA表达谱资料及临床病例资料.通过Cox回归模型、K-M曲线log-rank检验分析NADPH氧化酶NOX家族基因表达的预后意义,通过卡方检验分析NOX家族基因与ccRCC患者临床病例参数的相关性.采用基因集富集分析(GSEA)方法探讨NOX家族基因调控ccRCC可能的作用机制.结果 年龄、T分期、M分期、NOX1mRNA和DUOX1mRNA表达为ccRCC预后的独立风险因素.NOX1表达增加与ccRCC患者TNM分期和M分期相关.NOX1或DUOX1表达增加患者总生存期均明显短于表达减少患者(P=0.003),NOX1低表达样本富集了黏合连接、背腹轴形成等多种基因集.结论 在ccRCC中,NOX1或DUOX1高表达是一种预后不良因素,可能成为预测ccRCC患者转移发生、判断预后的有效生物标志物.
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