【摘 要】
：
目的采用血清代谢指纹采集方法筛选肺癌相关差异调控代谢物，为肺癌诊断提供候选标志物。方法在上海长海医院开展队列入组工作，共纳入2021年1月27日至6月4日的228例受试者，其中包括初诊确认肺癌患者97例和健康体检人群131名。根据标准流程采集入组队列血清样本，并通过分层随机抽样，将入组队列分为训练集和完全独立的验证集。采用纳米辅助激光解吸电离质谱对血清样品进行代谢指纹图谱采集。对训练集样本年龄、性别进行质量控制后，通过机器学习算法构建基于血清代谢指纹图谱的诊断模型，并采用受试者工作特征（ROC）曲线评价模
【机 构】
：
上海交通大学生物医学工程学院和医疗机器人研究所，上海200030海军军医大学附属长海医院实验诊断科，上海200433上海市胸科医院检验科，上海200230上海交通大学生物医学工程学院和医疗机器人研究所
论文部分内容阅读
目的采用血清代谢指纹采集方法筛选肺癌相关差异调控代谢物，为肺癌诊断提供候选标志物。
方法在上海长海医院开展队列入组工作，共纳入2021年1月27日至6月4日的228例受试者，其中包括初诊确认肺癌患者97例和健康体检人群131名。根据标准流程采集入组队列血清样本，并通过分层随机抽样，将入组队列分为训练集和完全独立的验证集。采用纳米辅助激光解吸电离质谱对血清样品进行代谢指纹图谱采集。对训练集样本年龄、性别进行质量控制后，通过机器学习算法构建基于血清代谢指纹图谱的诊断模型，并采用受试者工作特征（ROC）曲线评价模型的分类效能。
结果通过新型纳米辅助激光解吸电离质谱，可在1 min内完成血清样品的代谢指纹提取，过程仅需消耗1 μl原始血清。针对训练集，基于此构建的分类器诊断肺癌的ROC曲线下面积（AUC）为0.92（95%CI 0.87~0.97），敏感度为89%，特异度为89%。在独立验证队列中，AUC为0.96（95%CI 0.90~1.00），敏感度为91%，特异度为94%，没有表现出性能损失。确定了由5个代谢物组成的标志物组合，展示了肺癌患者的独特代谢模式。
结论本研究结合血清代谢指纹图谱和机器学习建立了肺癌的诊断模型，用于区分肺癌患者以及健康对照，可用于临床的体外诊断。
其他文献
心血管病是严重威胁人类生命和健康的重大公共卫生问题。近年来我国人群中心血管病，尤其是动脉粥样硬化性心血管病的疾病负担快速增长。心血管病是可以预防的，控制心血管病负担的增长需落实预防为主、关口前移的慢病防控方针。本文主要围绕动脉粥样硬化性心血管病，阐述了心血管病零级预防、一级预防和二级预防的概念和措施，以及心血管病预防的全人群策略和高危人群策略，并对心血管病预防的前景进行了展望。
伴随着精准医学理念的发展，在新型冠状病毒肺炎疫情流行的背景下，感染性疾病的临床诊疗愈发得到重视，而以分子生物学为核心的实验诊断技术作为感染性疾病临床实验诊断的重要手段尤其受关注。近年来，随着纳米材料、应用化学、光物理学和生物传感等技术的进步，分子诊断技术也迎来了革命性和创造性的发展。新一代定量PCR技术和基因测序技术、等温扩增技术、生物芯片和生物传感器技术在感染性疾病的临床诊断中具有应用前景和发展前途。
数字PCR（dPCR）是近年迅速发展起来的一种绝对定量的技术，该技术将含有DNA模板的反应体系分配到大量独立的反应单元中进行PCR，根据泊松分布和统计阳性信号来计算DNA拷贝数。与传统的qPCR相比，dPCR不依赖于扩增曲线，不受扩增效率的影响，具有较高的准确度和重复性，可以实现绝对定量。本文综述了数字PCR发展历史以及在感染性疾病分子诊断、肿瘤液体活检、产前诊断等方面的应用进展，并展望了该技术的应用前景。
类泛素化Neddylation修饰是一种新型蛋白质翻译后修饰方式，其在消化系统肿瘤中过度活化，是潜在的抗肿瘤分子靶标。靶向Neddylation修饰通路通过诱导消化系统肿瘤细胞发生细胞周期阻滞、细胞凋亡、细胞衰老和自噬，以及增强消化系统肿瘤细胞对放疗和化疗的敏感性，继而发挥抗肿瘤作用。靶向Neddylation修饰通路及通路抑制剂MLN4924可作用于抗消化系统肿瘤的潜在靶点。
目的观察液相色谱-串联质谱（LC-MS/MS）与免疫法检测多种类固醇激素的一致性。寻找多种类固醇激素在21-羟化酶缺乏症（21-OHD）中的诊断价值、筛选随访指标。方法2019年5月至2020年5月，武汉儿童医院收集实验组为109例接受规范治疗的经典型21-OHD患者，对照组为94名正常儿童。同时用免疫法和LC-MS/MS法检测17-羟孕酮（17-OHP）、雄烯二酮（Δ4-A）、睾酮和皮质醇。采用LC-MS/MS法检测另外16种肾上腺类固醇激素。实验组分为过度治疗组（17-OHP
目的应用超高效液相色谱串联四级杆飞行时间质谱（UPLC-Q-TOF/MS）技术，筛选对结核病诊断有辅助意义的代谢性生物标志物。方法回顾性病例对照的临床研究。随机选取2017年1月至2018年1月就诊于上海市肺科医院和上海市东方医院的102例结核病患者［男49例，女53例，年龄为40.0（24.0，48.5）岁］、100例就诊于上海市东方医院经结核分枝杆菌γ干扰素释放试验（TB-IGRA）检测为阳性者［男55例，女45例，年龄为44.0（37.0，52.0）岁］和96名健康体检者［男55例，女41例，年龄为
目的分析老年非小细胞肺癌（NSCLC）患者中血管内皮生长因子受体（EGFR）突变、程序性死亡配体1（PD-L1）、细胞增殖相关抗原（Ki-67）表达及其与患者性别、组织学类型、TNM分期等临床参数间的相关性。方法收集2020年1月至12月在复旦大学附属华东医院就诊的340例老年NSCLC患者组织标本，其中男性195例，女性145例，年龄（68.9±6.0）岁。按性别、组织学类型及TNM分期等临床参数对患者进行分组。采用超级突变扩增阻滞系统（Super-ARMS）方法及免疫组化方法检测老年NSCLC患者中E
目的用机器学习算法建立IgA肾病与非IgA肾病鉴别诊断模型。方法采用回顾性研究的方法，收集2019至2020年昆明医科大学第一附属医院、云南省第一人民医院和昆明市延安医院肾脏内科经肾脏病理确诊的患者共260例，其中原发性IgA肾病130例，非IgA肾病130例。收集包括性别和年龄等在内的28项临床资料和实验室常规检测结果，IgA肾病组与非IgA肾病组的男女构成比分别为59∶71和64∶66，年龄分别为37.20（21.89，53.78）、43.30（27.77，59.18）岁。将260例患者随机地分为训练
目的构建基于长链非编码RNA（lncRNA）的膀胱癌（BLCA）预后模型。方法从TCGA下载BLCA的lncRNA表达数据及临床信息，利用单因素Cox回归评估每个lncRNA表达水平与患者总生存期（OS）的相关性，将经多重比较校正P值
目的探究同时伴有低密度脂蛋白受体衔接蛋白1（LDLRAP1）及胆固醇转运蛋白三磷酸腺苷结合盒转运体G8（ABCG8）基因异常的家族性高胆固醇血症（FH）一家系的临床及分子生物学特征。方法2020年9月于上海交通大学医学院附属瑞金医院收治1例FH患者，采集该家系成员外周静脉血样本，检测血清总胆固醇（TC）、甘油三酯（TG）、低密度脂蛋白胆固醇（LDL-C）和高密度脂蛋白胆固醇（HDL-C）；用高效液相色谱法检测血清豆固醇和谷固醇含量。二代基因测序检测先证者及家系成员基因变异情况。采用Pymol软件对基因变异